Apesar de existirem algumas controversas a respeito da fundação da cidade de Onda Verde, o site oficial da prefeitura diz que o povoado surgiu em 1923. De acordo com o site, a ideia de se fundar uma cidade foi de João Ismael, um fazendeiro de origem árabe que morava nesta região no centro de um triângulo formado por Olímpia, Nova Granada e São José do Rio Preto. Ainda segundo o site, por volta de 1920, João Ismael teria obtida a informação de que na região da sua fazenda passaria os trilhos da Estrada de Ferro São Paulo Goiás. Com esse conhecimento, ele decidiu fundar um patrimônio.
Já no ano seguinte, em 1921, ainda segundo o site oficial, chegaram na região onde surgiria a Onda Verde, as primeiras famílias de origem japonesa: Tadaiti Kishi, Moragú Anzai, Naode Anzai, Toranoski Kano, Kit Siyhihara, Takaiti Saschara, Alfredo Kano, Hioschi Cano. Dois anos depois era fundado o povoado e criava-se escola mista do bairro dos castores, sob a responsabilidade da professora Hilda Spaulouse.
Uma das controvérsias mais fortes a respeito da história de Onda Verde é a mistura com a história dos Castores, que atualmente fica dentro do município ondaverdense. As primeiras informações a respeito do povoado de Castores e da Capela do Bom Jesus, atualmente um santuário que recebe em romaria milhares de pessoas nos dia 6 de agosto, são de 1898, de quanto o cidadão Matias de Carvalho Negrão solicitou junto à Câmara Municipal de Rio Preto autorização para construir um cemitério próximo ao córrego dos Castores, onde Tomé Correia de Paiva havia construído uma pequena capela de madeira para abrigar uma imagem do Senhor Bom Jesus, esculpida também em madeira.
Os sites da prefeitura e do IBGE que dizem que com o início da povoação no terreno loteado por João Ismael, após o erguimento de um cruzeiro e a construção de uma capela, os poucos moradores do patrimônio dos Castores, que já existia em 1904 conforme documentos da igreja católica, mudaram-se para nova vila.
O trem demorou para chegar. Somente em 1927 teriam chegado os primeiros ferroviários para o assentamento dos trilhos. Nesta época, ainda segundo o site oficial, várias famílias de fazendeiros encontravam-se instaladas no entorno do povoado. Famílias como as dos coronéis Neca Medeiros e Jacinto Honório de Melo, do capitão Joaquim Manoel da Cruz e de Izidoro Coimbra, Maria Manuela Prado, José Silvano, Antônio Batista Jerico, Macário José Andrade, Albertina Jesuína Lima Píton, Leolino Marques da Silva, José Gabriel de Oliveira, Maria Conceição de Abreu, Luís Belarmino e as famílias Sabugari e Maiero.
